1、 促進絮凝和沉澱：污水處理系統主要依靠細菌起淨化和絮凝作用，原生動物分泌的粘液能促使細菌發生絮凝作用，大部分原生動物如固著型纖毛蟲本身具有良好的沉降性能，加上和細菌形成絮體，更提高了在二沉池的泥水分離的效果。

2、 減少剩余污泥：從細菌到原生動物的轉換率約為0.5﹪，因此，只要原生動物捕食細菌，就會使生物量減少，減少的部分等於被氧化量。

3、 改善水質：原生動物除了吞噬游離細菌外，沉降過程中還會粘附和裹帶細菌，從而提高細菌的去除率。原生動物本身也可以攝取可溶性有機物，還可以和細菌一起吞噬水中的病毒。這些作用的結果是可以降低二沉池出水的BOD、COD、SS。提高出水的透明度。